（1）特殊治疗：对有慢性前列腺炎症状的患者，如细菌学不能发现致病菌，而其前列腺分泌物中又有大量的炎症细菌时，可作出非细菌性前列腺炎的诊断。由于不能确定支原体和衣原体是否为前列腺炎的病因，因此可针对这些病原体选用抗生素作临床试验。二甲胺四环素100mg，口服，每日3次，或红霉素500mg，口服，每日四次，至少试用四周。TMP和羧苄青霉素无效，因此凭经验连续使用抗生素是不合理的。相反，治疗主要是控制症状。症状急性发作期可选用抗炎药（布洛芬，400～600mg，口服，每日3次）。注意：以上用药一定要专业医师的指导下用药，不可自行用药。
许多学者认为前列腺切除术不适用于治疗此病，须让病人知道，前列腺非感染性炎症是一种慢性疾病，虽有令人烦恼的症状，但不会引起严重的后遗症，更不会危及生命。
（2）一般治疗：热水坐浴通常可缓解症状，注意饮食、对酒、咖啡及辛辣食物应当加以节制。鼓励病人尽可能地过正常的生活（包括性生活）。某些临床学家提倡作周期性前列腺按摩治疗，但也有学者对它的疗效表示怀疑。
